Cave Story was eerder al een succesje op WiiWare, maar zet nu de stap naar de 3DS en hoopt daar natuurlijk nog beter te doen. Om het verschil uit te leggen tussen beide versies heeft men 2 trailers vrijgegeven waarin je sowieso al het verschil kan zien in de graphics, aangezien 3D nu ook deel uitmaakt van Cave Story 3D.
